Проблема решилась полной переустановкой Kodi на MiBox3 с полным удалением всех оставшихся от приложения данных и последующей минимальной настройкой - по сути только лишь добавлением FTP как источника медиа контента.
Видимо, в предыдущей инсталляции у меня что-то было неправильно настроено, или какая-то настройка\плагин\еще что-то мешали нормальной работе с FTP сервером.
Теперь Kodi прекрасно воспроизводит видео файлы со встроенного FTP сервера роутера.
Тему можно считать решенной. Роутер был не при чем.
Большое спасибо! Вроде больше не сыпит эти сообщения в журнал. Я просто тому скрипту ставил chmod 0, думал этого будет достаточно, чтобы он перестал использоваться. Видимо этого было недостаточно.